南通市卫生健康委员会（Nantong Municipal Health Commission）简称“南通市卫生健康委”或“南通市卫健委” ，是南通市机构改革新组建的单位，为南通市人民政府工作部门 ，现任主任为卢红建 。内设机构另按有关规定设立工会、共青团、人民武装组织 ，办公时间为周一至周五 9:00-11:30、13:30-17:30 。
南通市卫生健康委员会负责贯彻落实中央关于卫生健康工作的方针政策和省市委的决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对卫生健康工作的集中统一领导，并与市医疗保障局在医疗、医保、医药等方面加强制度、政策衔接，建立沟通协商机制 。该委员会曾于2020年11月获得江苏省委、省政府授予“全省抗击新冠肺炎疫情先进集体”称号 ，于2021年10月被授予“江苏省脱贫攻坚暨对口帮扶支援合作先进集体”称号 ，并于2022年1月入选2019-2021年度江苏省文明单位候选名单 。2025年11月，南通市疾控中心工作人员陈志强在火灾救援中的行动体现了卫健系统“平战结合”培训体系的成效 。2026年6月，徐州医科大学南通临床学院在南通揭牌 。
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