《沉默的荣耀》39集大结局是一个悲壮与震撼交织的英雄终章。
核心剧情方面，东海小组因叛徒蔡孝乾出卖而暴露，吴石、聂曦、陈宝仓、朱枫等相继被捕。聂曦为保护同志强行发报牺牲，吴石利用国防部电台发出“绝笔”电报后坦然就擒。
高潮冲突环节，谷正文以聂曦遗书对吴石进行攻心，但吴石当庭手绘情报揭露“海东青计划”，直面墙后蒋介石父子，痛斥国民党腐败。蒋经国对其劝降也遭到拒绝，吴石留下“俯仰无愧天地，褒贬自有春秋”的遗言。
结局走向是，黎晴在老杜牺牲的掩护下成功送出情报，舟山群岛得以解放。而吴石、陈宝仓、聂曦、朱枫等带着微笑走向刑场，与之形成鲜明对比的是叛徒蔡孝乾叛变苟活。
观众对这一结局反馈热烈，该大结局被评为“今年最震撼大结局”，演员于和伟、余皑磊等的演技获得称赞，剧中的英雄群像以及他们所展现出的信仰力量引发了观众的强烈共鸣。
