两者区别有机构性质不同、收养对象不同、资金来源不同。1、机构性质不同：孤儿院是收养社会遗弃婴儿的慈善机构；福利院是国家、社会及团体为救助社会困难人士、疾病患者而创建的福利事业单位。2、收养对象不同：孤儿院收养的是被遗弃的婴儿；福利院分为老人、成残、儿童三种类型，老人福利院收养的是自费老人和“三无”老人等，成残福利院收养的是自费残疾人、“三无”残疾人等，儿童福利院收养的是孤儿、残儿、自费残儿等。3、资金来源不同：孤儿院和福利院都是国家和政府兴办的福利事业单位，但孤儿院一般为全额拨款，而福利院有全额拨款和差额拨款两种。
