孙埠镇的历史可以追溯到一个名为乌沙埂的小村落，最初是临水阳江上几户渔民的居所。村南住着一位姓孙的老人，他为了方便村民，开设了一家店铺，这个村落因此被称为“孙家铺”。由于其下方河道水流深缓，船只频繁经过，孙家铺逐渐成为竹木和粮食的集散地。商船带来了上海、南京等地的商品，如“洋油”、“洋火”和“洋布”，使得孙家铺成为宣州东部的日杂百货批发中心，主要依赖水路运输发展起来，从此改名为孙家埠。清朝前期，孙家埠具有重要的军事意义，咸丰年间，它隶属于乡下的孙埠团。据光绪十四年县志记载，孙家埠正式被称为镇，之后历经更名，如1932年改为永宁镇，1946年恢复原名孙埠镇。解放初期，孙埠镇曾归属不同的行政区划，最终在1952年7月被划为乡建镇，分为桂仕、正兴和长河三个乡。1955年秋后，孙埠镇成为县直属镇，设有五个居委会。1958年，孙埠镇与双桥、正兴、佟公三乡合并成立超美（双桥）人民公社，随着公社体制的调整，孙埠镇的管辖范围有所变化。1965年8月，孙埠镇独立设立，与孙埠公社并存，直至1983年，孙埠公社转为孙埠乡，1984年与镇合并为现在的孙埠镇。2001年的区划调整中，建国乡并入孙埠镇，现在的孙埠镇位于正兴大街，总面积117.6平方公里，包括耕地53218亩和山场46257亩，属于佟公坝灌区的平畈地带，由八个村和一个社区组成，共有331个村民组，15446户居民，人口为54360人。
