郑州大学校长是正厅级。具体分析如下：
校长级别的判定依据：高校行政级别直接对应单位级别，校长职务与单位行政级别一致。郑州大学作为正厅级单位，其校长职务自然为正厅级。这一规则适用于国内绝大多数公立本科院校，例如非985的211高校、省属重点大学等。
郑州大学的特殊背景：郑州大学由原郑州大学、郑州工业大学、河南医科大学于2000年合并组建，是河南省唯一入选国家“世界一流大学建设高校”的综合性大学，涵盖12大学科门类。尽管其综合实力和学科规模突出，但行政级别仍遵循国家统一划分标准，未因合并或学科优势提升级别。
与副部级高校的对比：国内32所副部级985高校（如北京大学、清华大学等）的校长为副部级，这类高校通常具有更强的国家战略地位和资源倾斜。郑州大学作为211高校，虽在地方高等教育中占据重要地位，但行政级别与副部级高校存在明确区分。
行政级别的实际意义：高校行政级别主要影响校内管理架构和对外行政协调权限。正厅级校长在省内教育系统中具有较高话语权，但在跨部门协作或国家层面资源争取中，副部级高校校长可能更具优势。不过，这一差异不影响学校的教学科研核心职能。
历史沿革的稳定性：高校行政级别一旦确定，通常不会因学科调整或合并重组轻易变动。郑州大学自2000年合并后，其行政级别始终保持正厅级，未因后续入选“双一流”建设高校而升级，体现了行政级别划分的稳定性。
地方高校的普遍情况：除少数副部级高校外，国内绝大多数省属211高校和地方重点大学均为正厅级单位。例如，云南大学、新疆大学等“双一流”建设高校（非985）的校长同样为正厅级，这与郑州大学的情况一致。
总结：郑州大学作为正厅级单位，其校长职务级别为正厅级。这一结论基于国家对高校行政级别的统一划分标准，结合郑州大学的211高校属性和地方重点大学定位得出，符合国内高校管理体制的普遍规则。
